Bu çalışmada daha önce Akdeniz Bölgesindeki bir alabalık işletmesinde ortaya çıkan laktokokkozis salgını esnasında izole edilen Lactococcus garvieae izolatına karşı endojen gökkuşağı alabalığı mikrobiyotasının probiyotik özellikleri değerlendirildi. Bu amaçla sağlıklı 20 adet gökkuşağı alabalığının (ort. 250g) bağırsaklarından aday probiyotik bakterilerilerin izolasyonu yapıldı. İzole edilen 157 adet bakterinin Agar Kuyu Difüzyon yöntemi kullanılarak L. garvieae'ya karşı antagonistik aktiviteleri araştırıldı. Antagonistik suşların fenotipik identifikasyonlarından sonra, PCR ile 16S rRNA bölgesinin dizi analizi yapılarak bakteri türlerinin identifikasyonları yapılmıştır. Çalışmada L.garvieae (TUB/2013/L32), L. garvieae (TUB/2013/L95), Bacillus sp. (TUB/2013/L97) ve Aeromonas sobria (TUB/2013/L63) olmak üzere 4 antagonistik suş tanımlanmıştır. Sonuç olarak, L.garvieae (TUB/2013/L95) hariç olmak üzere diğer suşların in vitro probiyotik özelliklere (hidrofobik, safra tuzlarına ve düşük pH şartlarına dirençli olma) sahip oldukları saptandı. Anahtar Kelimeler: Aeromonas, Akuakültür, Bacillus, Lactococcus, Lactococcus garvieae, Oncorhyncus mykiss, Probiyotik
In this study, probiotic properties of endogenous rainbow trout microbiota against Lactococcus garvieae isolated duringan out break of lactoccosisin a trout farm in the Mediterranean region were evaluated. For this purpose, candidate probiotic bacteria were isolated from rainbow trout (n=20, weight of 250g) intestines. A total of 157 bacteria were screened for antagonistic activity against L. garvieae by using the Well Diffusion Agar method. After the phenotypic identification of antagonistic strains, confirmation of bacterial species was made by 16S rRNA gene sequence analysis of the strains. As a result, four antagonistic strains were identified including L. garviea (TUB/2013/L32), L. garvieae (TUB/2013/L95), Bacillus sp. (TUB/2013/L97) and Aeromonas sobria (TUB/2013/L63). As a result, it was found tha tstrains have in vitro probiotic properties (hidrophobic, tolerant to bile salts and low pH conditions) except for L. garvieae(TUB/2013/L95). Keywords: Aeromonas, Aquaculture, Bacillus, Lactococcus, Lactococcus garvieae, Oncorhynchus mykiss, Probiotic
Tez (Yüksek Lisans) - Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü,Su Ürünleri Yetiştiriciliği Anabilim Dalı, 2016.
Kaynakça var.
Bu çalışmada daha önce Akdeniz Bölgesindeki bir alabalık işletmesinde ortaya çıkan laktokokkozis salgını esnasında izole edilen Lactococcus garvieae izolatına karşı endojen gökkuşağı alabalığı mikrobiyotasının probiyotik özellikleri değerlendirildi. Bu amaçla sağlıklı 20 adet gökkuşağı alabalığının (ort. 250g) bağırsaklarından aday probiyotik bakterilerilerin izolasyonu yapıldı. İzole edilen 157 adet bakterinin Agar Kuyu Difüzyon yöntemi kullanılarak L. garvieae'ya karşı antagonistik aktiviteleri araştırıldı. Antagonistik suşların fenotipik identifikasyonlarından sonra, PCR ile 16S rRNA bölgesinin dizi analizi yapılarak bakteri türlerinin identifikasyonları yapılmıştır. Çalışmada L.garvieae (TUB/2013/L32), L. garvieae (TUB/2013/L95), Bacillus sp. (TUB/2013/L97) ve Aeromonas sobria (TUB/2013/L63) olmak üzere 4 antagonistik suş tanımlanmıştır. Sonuç olarak, L.garvieae (TUB/2013/L95) hariç olmak üzere diğer suşların in vitro probiyotik özelliklere (hidrofobik, safra tuzlarına ve düşük pH şartlarına dirençli olma) sahip oldukları saptandı. Anahtar Kelimeler: Aeromonas, Akuakültür, Bacillus, Lactococcus, Lactococcus garvieae, Oncorhyncus mykiss, Probiyotik
In this study, probiotic properties of endogenous rainbow trout microbiota against Lactococcus garvieae isolated duringan out break of lactoccosisin a trout farm in the Mediterranean region were evaluated. For this purpose, candidate probiotic bacteria were isolated from rainbow trout (n=20, weight of 250g) intestines. A total of 157 bacteria were screened for antagonistic activity against L. garvieae by using the Well Diffusion Agar method. After the phenotypic identification of antagonistic strains, confirmation of bacterial species was made by 16S rRNA gene sequence analysis of the strains. As a result, four antagonistic strains were identified including L. garviea (TUB/2013/L32), L. garvieae (TUB/2013/L95), Bacillus sp. (TUB/2013/L97) and Aeromonas sobria (TUB/2013/L63). As a result, it was found tha tstrains have in vitro probiotic properties (hidrophobic, tolerant to bile salts and low pH conditions) except for L. garvieae(TUB/2013/L95). Keywords: Aeromonas, Aquaculture, Bacillus, Lactococcus, Lactococcus garvieae, Oncorhynchus mykiss, Probiotic