Tıp Fakültesi koleksiyonlarını içerir. http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/23096 2026-09-25T22:54:54Z 2026-09-25T22:54:54Z http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/103089 2025-02-25T10:50:02Z

Pozitif kan kültürü şişelerinden karbapenemaz üreten Enterobacterales suşlarının hızlı tespiti ve karbapenemaz karakterizasyonu amacıyla kombinasyon disk testlerinin doğrudan beta-laktam inaktivasyon metoduna dayalı olarak kullanımının etkinliğinin araştırılması = Investigation of the effectiveness of using combination disc tests based on the direct beta-lactam inactivation method for the rapid detection and characterization of carbapenemase producing Enterobacterales strains from positive blood culture bottles / Toplum ve hastane kaynaklı enfeksiyonların başlıca etkenlerinden olan Enterobacterales'in neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde son tercih olan karbapenemlere karşı antimikrobiyal direnç giderek artmakta ve karbapenem direnci sıklıkla karbapenemaz enzimi üretimi ile olmaktadır. Karbapenemaz enzimlerinin erken tespit edilmesi hem tedavinin doğru planlanabilmesi hem de enfeksiyon kontrolünde oldukça önemlidir. Çalışmamızda, doğrudan beta-laktam inaktivasyon metodunun kombinasyon disk testine dayalı fenotipik yöntemlerle birlikte kullanımının (dBLIMplus) karbapenemaz üreten Enterobacterales suşlarının pozitif kan kültürü şişelerinden hızlı tespitinde ve karbapanemaz karakterizasyonunda etkinliği değerlendirilmiştir. Hastane kaynaklı enfeksiyon etkeni olarak değerlendirilip Escherichia coli veya Klebsiella pneumoniae olarak tanımlanan 60 adet suş (PZR ile belirlenmiş 15'er adet A, B, D sınıfı karbapenemaz pozitif ve 15 adet karbapenemaz negatif) dBLIMplus validasyonu için seçilmiştir. Validasyon suşlarına dBLIMplus uygulanarak dBLIMplus değerlendirme zon çapı kriterleri belirlenmiştir. Daha sonra dBLIMplus'ın rutin laboratuvarda kullanımını değerlendirmek için E. coli veya K. pneumoniae olarak tanımlanan toplamda 100 adet klinik suşa dBLIMplus uygulanıp, değerlendirilmiştir. dBLIMplus'ın 6. saatte değerlendirilmesinin daha uygun olduğu, karbapanemaz aktivitesini %100 duyarlılık ve özgüllükle, karbapenemaz karakterizasyonunu ise %92,8 duyarlılık ve %100 özgüllükle tespit ettiği bulunmuştur (Mc Nemar, p=0,125; Cohen Kappa ĸ=0,920). Tek bir karbapenemaz sınıfına ait direnç geni tespit edilen 24 klinik suşun 22'sinde (%91,6) dBLIMplus ile doğru Ambler sınıfı belirlenebilmiş, A sınıfı karbapenemazları tespit etmede duyarlılığı %87,5, özgüllüğü %100; D sınıfı karbapanemazları tespit etmede duyarlılığı %93,7, özgüllüğü %98,8 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, dBLIMplus doğrudan pozitif kan kültürü şişelerinden karbapenemaz aktivitesinin tespiti ve karakterizasyonunda referans yöntemle %90'ın üzerindeki uyumu ile rutin laboratuvar uygulamalarında kullanılabilecek oldukça uygun bir fenotipik yöntem olarak ileri sürülebilir. dBLIMplus ile hızlı karbapenemaz tespiti antimikrobiyal yönetim ve enfeksiyon kontrol uygulamaları açısından hız kazandıracağı gibi, uygunsuz antimikrobiyal kullanımını sınırlayarak antimikrobiyal direncin azalmasına da katkı sağlayacaktır. Anahtar Kelimeler : antimikrobiyal yönetim, dBLIMplus, Enterobacterales, hızlı tespit, karbapenemaz.; Antimicrobial resistance is gradually increasing against carbapenems, which are the last choice in the treatment of infections caused by Enterobacterales, one of the main causes of community and hospital-acquired infections and carbapenem resistance is mainly caused by the production of carbapenemase enzymes. Early detection of carbapenemase enzymes is crucial for the appropriate management of treatment and infection control. In this study, the effectiveness of the direct beta-lactam inactivation method combined with combination disk test-based phenotypic methods (dBLIMplus) was evaluated in the rapid detection and carbapenemase characterization of carbapenemase-producing Enterobacterales strains from positive blood culture bottles. Sixty strains (15 each of class A, B, D carbapenemase positive and 15 carbapenemase negative by PCR), which were evaluated as the causative agent of hospital-acquired infection and identified as Escherichia coli or Klebsiella pneumoniae, were selected for dBLIMplus validation. dBLIMplus evaluation zone diameter criteria were determined by applying dBLIMplus to the validation strains. To evaluate the utility of dBLIMplus in the routine laboratory, dBLIMplus was applied to a total of 100 clinical strains identified as E. coli or K. pneumoniae. It was determined that it was more appropriate to evaluate dBLIMplus at the 6th hour and that dBLIMplus detected carbapenemase activity with 100% sensitivity and specificity, while carbapenemase characterization could be performed with 92.8% sensitivity and 100% specificity (Mc Nemar, p=0,125; Cohen Kappa ĸ=0,920). The correct Ambler class could be determined with dBLIMplus in 22/24 clinical strains (91.6%) in which a resistance gene belonging to a single carbapenemase class was detected. While the sensitivity of dBLIMplus in detecting class A carbapenemases was 87.5% and its specificity was 100%, its sensitivity in detecting class D carbapenemases was found to be 93.7% and its specificity was 98.8%. In conclusion, dBLIMplus can be suggested as a highly appropriate phenotypic method that can be used in routine laboratory applications, with over 90% compatibility with the reference method in the detection and characterization of carbapenemase activity directly from positive blood culture bottles. Rapid carbapenemase detection will accelerate antimicrobial management and infection control practices, as well as contribute to the reduction of antimicrobial resistance by limiting inappropriate antimicrobial use. Keywords : antimicrobial management, dBLIMplus, Enterobacterales, rapid detection, carbapenemase.; Tez (Uzmanlık Tezi- PhD) - Süleyman Demirel Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 2024.; Kaynakça var.; Toplum ve hastane kaynaklı enfeksiyonların başlıca etkenlerinden olan Enterobacterales'in neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde son tercih olan karbapenemlere karşı antimikrobiyal direnç giderek artmakta ve karbapenem direnci sıklıkla karbapenemaz enzimi üretimi ile olmaktadır. Karbapenemaz enzimlerinin erken tespit edilmesi hem tedavinin doğru planlanabilmesi hem de enfeksiyon kontrolünde oldukça önemlidir. Çalışmamızda, doğrudan beta-laktam inaktivasyon metodunun kombinasyon disk testine dayalı fenotipik yöntemlerle birlikte kullanımının (dBLIMplus) karbapenemaz üreten Enterobacterales suşlarının pozitif kan kültürü şişelerinden hızlı tespitinde ve karbapanemaz karakterizasyonunda etkinliği değerlendirilmiştir. Hastane kaynaklı enfeksiyon etkeni olarak değerlendirilip Escherichia coli veya Klebsiella pneumoniae olarak tanımlanan 60 adet suş (PZR ile belirlenmiş 15'er adet A, B, D sınıfı karbapenemaz pozitif ve 15 adet karbapenemaz negatif) dBLIMplus validasyonu için seçilmiştir. Validasyon suşlarına dBLIMplus uygulanarak dBLIMplus değerlendirme zon çapı kriterleri belirlenmiştir. Daha sonra dBLIMplus'ın rutin laboratuvarda kullanımını değerlendirmek için E. coli veya K. pneumoniae olarak tanımlanan toplamda 100 adet klinik suşa dBLIMplus uygulanıp, değerlendirilmiştir. dBLIMplus'ın 6. saatte değerlendirilmesinin daha uygun olduğu, karbapanemaz aktivitesini %100 duyarlılık ve özgüllükle, karbapenemaz karakterizasyonunu ise %92,8 duyarlılık ve %100 özgüllükle tespit ettiği bulunmuştur (Mc Nemar, p=0,125; Cohen Kappa ĸ=0,920). Tek bir karbapenemaz sınıfına ait direnç geni tespit edilen 24 klinik suşun 22'sinde (%91,6) dBLIMplus ile doğru Ambler sınıfı belirlenebilmiş, A sınıfı karbapenemazları tespit etmede duyarlılığı %87,5, özgüllüğü %100; D sınıfı karbapanemazları tespit etmede duyarlılığı %93,7, özgüllüğü %98,8 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, dBLIMplus doğrudan pozitif kan kültürü şişelerinden karbapenemaz aktivitesinin tespiti ve karakterizasyonunda referans yöntemle %90'ın üzerindeki uyumu ile rutin laboratuvar uygulamalarında kullanılabilecek oldukça uygun bir fenotipik yöntem olarak ileri sürülebilir. dBLIMplus ile hızlı karbapenemaz tespiti antimikrobiyal yönetim ve enfeksiyon kontrol uygulamaları açısından hız kazandıracağı gibi, uygunsuz antimikrobiyal kullanımını sınırlayarak antimikrobiyal direncin azalmasına da katkı sağlayacaktır. Anahtar Kelimeler : antimikrobiyal yönetim, dBLIMplus, Enterobacterales, hızlı tespit, karbapenemaz.; Antimicrobial resistance is gradually increasing against carbapenems, which are the last choice in the treatment of infections caused by Enterobacterales, one of the main causes of community and hospital-acquired infections and carbapenem resistance is mainly caused by the production of carbapenemase enzymes. Early detection of carbapenemase enzymes is crucial for the appropriate management of treatment and infection control. In this study, the effectiveness of the direct beta-lactam inactivation method combined with combination disk test-based phenotypic methods (dBLIMplus) was evaluated in the rapid detection and carbapenemase characterization of carbapenemase-producing Enterobacterales strains from positive blood culture bottles. Sixty strains (15 each of class A, B, D carbapenemase positive and 15 carbapenemase negative by PCR), which were evaluated as the causative agent of hospital-acquired infection and identified as Escherichia coli or Klebsiella pneumoniae, were selected for dBLIMplus validation. dBLIMplus evaluation zone diameter criteria were determined by applying dBLIMplus to the validation strains. To evaluate the utility of dBLIMplus in the routine laboratory, dBLIMplus was applied to a total of 100 clinical strains identified as E. coli or K. pneumoniae. It was determined that it was more appropriate to evaluate dBLIMplus at the 6th hour and that dBLIMplus detected carbapenemase activity with 100% sensitivity and specificity, while carbapenemase characterization could be performed with 92.8% sensitivity and 100% specificity (Mc Nemar, p=0,125; Cohen Kappa ĸ=0,920). The correct Ambler class could be determined with dBLIMplus in 22/24 clinical strains (91.6%) in which a resistance gene belonging to a single carbapenemase class was detected. While the sensitivity of dBLIMplus in detecting class A carbapenemases was 87.5% and its specificity was 100%, its sensitivity in detecting class D carbapenemases was found to be 93.7% and its specificity was 98.8%. In conclusion, dBLIMplus can be suggested as a highly appropriate phenotypic method that can be used in routine laboratory applications, with over 90% compatibility with the reference method in the detection and characterization of carbapenemase activity directly from positive blood culture bottles. Rapid carbapenemase detection will accelerate antimicrobial management and infection control practices, as well as contribute to the reduction of antimicrobial resistance by limiting inappropriate antimicrobial use. Keywords : antimicrobial management, dBLIMplus, Enterobacterales, rapid detection, carbapenemase.

http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/103087 2025-02-25T10:50:02Z

Deneysel sirkadiyen ritim modelinde beslenme zamanlaması ve omega-3 desteğinin metabolizma üzerine etkisinin araştırılması = Investigation of the effect of nutritional timing and omega-3 support on metabolism in experimental circadian rhythm model / Günümüzde modern yaşamında etkisiyle vücut iç saatimiz ve dış faktörlerin arasındaki senkronizasyonun bozulması sonucu fizyolojik, biyokimyasal ve davranışsal durumlarımızda görülen problemler gittikçe artmaktadır. Yapılan son araştırmalar omega-3 desteğinin genel sağlık üzerine yararlı etkilerini öne çıkarmıştır. Çalışmamızda sirkadiyen ritmi bozulan genç sıçanlarda metabolik homeastazın bozulmasına bağlı olumsuz etkileri ve omega-3 desteğinin koruyucu etkisi araştırılmıştır. Spraque Dawley ırkı dişi 8 haftalık sıçanlar, kontrol grubunda 6, SR grubunda 7, BY ve KT grubunda 8 adet olmak üzere rastgele 4 gruba ayrıldı. Her gruba 10 gün boyunca 12/12 aydınlık karanlık döngüsünde adaptasyon uygulandı. Daha sonra kontrol grubu hariç bütün gruplara 3 gün 12/12 aydınlık karanlık, sonraki 24 saat boyunca ışık, sonraki 3 gün 12/12 karanlık aydınlık sirkadiyen ritim bozukluğu oluşturma metodu deney süresince düzenli sikluslarla uygulandı. Kontrol ve SR grubundaki sıçanlar 25 gün boyunca serum fizyolik ile gavaj stresine tabi tutuldu. BY grubundaki sıçanlara 25 gün boyunca oral gavajla 400 mg/kg/gün balık yağı verildi. KT grubundaki sıçanlara 25 gün boyunca 1000 mg/kg/gün keten tohumu yağı oral gavajla verildi. Sıçanlar anestezi altında sakrifiye edilerek karaciğer dokusu çıkartıldı. Biyokimyasal analizlerde karaciğer hasarı biyobelirteçleri olan ALT (alanin aminotransferaz) ve AST (aspartat transaminaz) serum düzeyleri incelendi. AST parametresinde kontrol grubu ile diğer tüm gruplar arasında anlamlı farklılık bulundu (p=0,00). Kontrol grubundakilerin ortalaması diğer gruplara göre daha düşük ortalamaya sahiptir. ALT parametresinde kontrol grubu ile diğer tüm gruplar arasında anlamlı farklılık bulundu (p=0,00). Kontrol grubundakilerin ortalaması diğer gruplara göre daha düşük ortalamaya sahiptir. Histopatolojik analizler, IL-1β, myeloperoksidaz, SIRT ekspresyonları immunohistokimyasal olarak incelendi. Histopatolojik olarak SR grubunda karaciğerde dejenerasyon, hiperemi ve inflamasyonda belirgin artış, BY ve KT gruplarında bu bulgularda belirgin azalma, BY grubunda bu azalmanın daha belirgin olduğu görüldü. İmmünohistokimyasal olarak karaciğerde SR grubunda IL-1β, myeloperoksidaz ekspresyonlarında belirgin artış, BY ve KT gruplarında bu ekspresyonlarda azalma görüldü. SIRT ekspresyonunda SR grubunun karaciğerlerinde önemli ölçüde azalma, BY ve KT gruplarında ekspresyonlarda artış şekillendiği ancak bu artışın her iki grupta da çok belirgin olmadığı saptandı. Sonuçta sirkadiyen ritim bozukluğunun karaciğer dokusunda dejenerasyon ve stres yarattığı, balık yağı ve keten tohumu yağının ise bu bulguları iyileştirici etkisi olduğu ortaya konuldu. Anahtar Kelimeler : Sirkadiyen ritim, Karaciğer, Metabolizma, Omega-3, Balık yağı, Keten tohumu yağı.; Nowadays, with the influence of modern life, the problems seen in our physiological, biochemical and behavioral states are increasing as a result of the desynchronization between our internal body clock and external factors. Recent research has highlighted the beneficial effects of omega-3 supplementation on general health. In our study, the negative effects of metabolic homeostasis in young rats with disrupted circadian rhythm and the protective effect of omega-3 supplementation were investigated. Spraque Dawley type female 8-week-old rats were randomly divided into 4 groups: 6 in the control group, 7 in the SR group, and 8 in the BY and KT groups. Each group was adapted to a 12/12 light-dark cycle for 10 days. Then, the circadian rhythm creation method of 12/12 light-dark for 3 days, light for the next 24 hours, and 12/12 dark-light for the next 3 days was applied to all groups except the control group in regular cycles throughout the experiment. Rats in the control and SR groups were subjected to gavage stress with serum physiolic for 25 days. Rats in the BY group were given 400 mg/kg/day fish oil by oral gavage for 25 days. Rats in the KT group were given 1000 mg/kg/day flaxseed oil by oral gavage for 25 days. The rats were sacrificed under anesthesia and liver tissue was removed. Histopathological analyses, IL-1β, myeloperoxidase and SIRT1 expressions were examined immunohistochemically. In biochemical analyses, serum levels of ALT (alanine aminotransferase) and AST (aspartate transaminase), which are biomarkers of liver damage, were examined. A significant difference was found in the AST parameter between the control group and all other groups (p = 0.00). The average of the control group is lower than the other groups. A significant difference was found in the ALT parameter between the control group and all other groups (p = 0.00). The average of the control group is lower than the other groups. Histopathologically, a significant increase in liver degeneration, hyperenemia and inflammation was observed in the SR group, a significant decrease in these findings was observed in the BY and KT groups, and this decrease was more pronounced in the BY group. Imminohistochemically, a significant increase in IL-1β and myeloperoxidase expressions was observed in the liver in the SR group, while a decrease in these expressions was observed in the BY and KT groups. It was determined that there was a significant decrease in SIRT expression in the livers of the SR group, and an increase in expression in the BY and KT groups, but this increase was not very significant in both groups. As a result, it was revealed that circadian rhythm disorder caused degeneration and stress in the liver tissue, and fish oil and flaxseed oil had a healing effect on these findings. As a result, it was revealed that circadian rhythm disorder causes degeneration and stress in the liver tissue, and fish oil and flaxseed oil had a healing effect on this findings. Keywords : Circadian rhythm, Liver, Metabolism, Omega-3, Fish oil, Flaxseed oil.; Tez (Tıpta Uzmanlık-PhD) - Süleyman Demirel Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Fizyoloji Anabilim Dalı, 2024.; Kaynakça var.; Günümüzde modern yaşamında etkisiyle vücut iç saatimiz ve dış faktörlerin arasındaki senkronizasyonun bozulması sonucu fizyolojik, biyokimyasal ve davranışsal durumlarımızda görülen problemler gittikçe artmaktadır. Yapılan son araştırmalar omega-3 desteğinin genel sağlık üzerine yararlı etkilerini öne çıkarmıştır. Çalışmamızda sirkadiyen ritmi bozulan genç sıçanlarda metabolik homeastazın bozulmasına bağlı olumsuz etkileri ve omega-3 desteğinin koruyucu etkisi araştırılmıştır. Spraque Dawley ırkı dişi 8 haftalık sıçanlar, kontrol grubunda 6, SR grubunda 7, BY ve KT grubunda 8 adet olmak üzere rastgele 4 gruba ayrıldı. Her gruba 10 gün boyunca 12/12 aydınlık karanlık döngüsünde adaptasyon uygulandı. Daha sonra kontrol grubu hariç bütün gruplara 3 gün 12/12 aydınlık karanlık, sonraki 24 saat boyunca ışık, sonraki 3 gün 12/12 karanlık aydınlık sirkadiyen ritim bozukluğu oluşturma metodu deney süresince düzenli sikluslarla uygulandı. Kontrol ve SR grubundaki sıçanlar 25 gün boyunca serum fizyolik ile gavaj stresine tabi tutuldu. BY grubundaki sıçanlara 25 gün boyunca oral gavajla 400 mg/kg/gün balık yağı verildi. KT grubundaki sıçanlara 25 gün boyunca 1000 mg/kg/gün keten tohumu yağı oral gavajla verildi. Sıçanlar anestezi altında sakrifiye edilerek karaciğer dokusu çıkartıldı. Biyokimyasal analizlerde karaciğer hasarı biyobelirteçleri olan ALT (alanin aminotransferaz) ve AST (aspartat transaminaz) serum düzeyleri incelendi. AST parametresinde kontrol grubu ile diğer tüm gruplar arasında anlamlı farklılık bulundu (p=0,00). Kontrol grubundakilerin ortalaması diğer gruplara göre daha düşük ortalamaya sahiptir. ALT parametresinde kontrol grubu ile diğer tüm gruplar arasında anlamlı farklılık bulundu (p=0,00). Kontrol grubundakilerin ortalaması diğer gruplara göre daha düşük ortalamaya sahiptir. Histopatolojik analizler, IL-1β, myeloperoksidaz, SIRT ekspresyonları immunohistokimyasal olarak incelendi. Histopatolojik olarak SR grubunda karaciğerde dejenerasyon, hiperemi ve inflamasyonda belirgin artış, BY ve KT gruplarında bu bulgularda belirgin azalma, BY grubunda bu azalmanın daha belirgin olduğu görüldü. İmmünohistokimyasal olarak karaciğerde SR grubunda IL-1β, myeloperoksidaz ekspresyonlarında belirgin artış, BY ve KT gruplarında bu ekspresyonlarda azalma görüldü. SIRT ekspresyonunda SR grubunun karaciğerlerinde önemli ölçüde azalma, BY ve KT gruplarında ekspresyonlarda artış şekillendiği ancak bu artışın her iki grupta da çok belirgin olmadığı saptandı. Sonuçta sirkadiyen ritim bozukluğunun karaciğer dokusunda dejenerasyon ve stres yarattığı, balık yağı ve keten tohumu yağının ise bu bulguları iyileştirici etkisi olduğu ortaya konuldu. Anahtar Kelimeler : Sirkadiyen ritim, Karaciğer, Metabolizma, Omega-3, Balık yağı, Keten tohumu yağı.; Nowadays, with the influence of modern life, the problems seen in our physiological, biochemical and behavioral states are increasing as a result of the desynchronization between our internal body clock and external factors. Recent research has highlighted the beneficial effects of omega-3 supplementation on general health. In our study, the negative effects of metabolic homeostasis in young rats with disrupted circadian rhythm and the protective effect of omega-3 supplementation were investigated. Spraque Dawley type female 8-week-old rats were randomly divided into 4 groups: 6 in the control group, 7 in the SR group, and 8 in the BY and KT groups. Each group was adapted to a 12/12 light-dark cycle for 10 days. Then, the circadian rhythm creation method of 12/12 light-dark for 3 days, light for the next 24 hours, and 12/12 dark-light for the next 3 days was applied to all groups except the control group in regular cycles throughout the experiment. Rats in the control and SR groups were subjected to gavage stress with serum physiolic for 25 days. Rats in the BY group were given 400 mg/kg/day fish oil by oral gavage for 25 days. Rats in the KT group were given 1000 mg/kg/day flaxseed oil by oral gavage for 25 days. The rats were sacrificed under anesthesia and liver tissue was removed. Histopathological analyses, IL-1β, myeloperoxidase and SIRT1 expressions were examined immunohistochemically. In biochemical analyses, serum levels of ALT (alanine aminotransferase) and AST (aspartate transaminase), which are biomarkers of liver damage, were examined. A significant difference was found in the AST parameter between the control group and all other groups (p = 0.00). The average of the control group is lower than the other groups. A significant difference was found in the ALT parameter between the control group and all other groups (p = 0.00). The average of the control group is lower than the other groups. Histopathologically, a significant increase in liver degeneration, hyperenemia and inflammation was observed in the SR group, a significant decrease in these findings was observed in the BY and KT groups, and this decrease was more pronounced in the BY group. Imminohistochemically, a significant increase in IL-1β and myeloperoxidase expressions was observed in the liver in the SR group, while a decrease in these expressions was observed in the BY and KT groups. It was determined that there was a significant decrease in SIRT expression in the livers of the SR group, and an increase in expression in the BY and KT groups, but this increase was not very significant in both groups. As a result, it was revealed that circadian rhythm disorder caused degeneration and stress in the liver tissue, and fish oil and flaxseed oil had a healing effect on these findings. As a result, it was revealed that circadian rhythm disorder causes degeneration and stress in the liver tissue, and fish oil and flaxseed oil had a healing effect on this findings. Keywords : Circadian rhythm, Liver, Metabolism, Omega-3, Fish oil, Flaxseed oil.

http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/103080 2025-02-25T10:50:01Z

Göller bölgesinden hastanemize başvuran akciğer kanseri ön tanısı olan hastaların bronkoskopi verilerinin araştırılması = Investigation of bronchoscopy data of patients with a preliminary diagnosis of lung cancer who admitted to our hospital from the lakes region / Akciğer kanseri sık görülmesi ve yüksek ölüm oranlarına sahip olması nedeniyle halk sağlığı açısından önemli bir sağlık sorunudur. Tanı yöntemlerinin gelişmesi ve sağlık hizmetlerine erişimin artmasıyla her yıl daha fazla kanser vakası teşhis edilmektedir. Erken tanı ve tedavi konusundaki gelişmelerle birlikte günümüzde akciğer kanserini önleme ve korunma çalışmaları da önem kazanmaktadır. Sunulan çalışmada ilimizin (85) de içinde bulunduğu göller bölgesinde yaşayan, akciğer kanseri ön tanısı ile hastanemize başvurup bronkopskopi yapılan hastaların demografik özellikleri ile bronkoskopi işlemi sonucunda elde edilen bulguların karşılaştırılması amaçlanmıştır. Süleyman Demirel Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesine göller bölgesinden 2018-2023 yılları arasında başvuran ve bronkopskopi yapılan 413 hasta retrospektif olarak araştırılmıştır. Hastaların cinsiyetleri, bronkoskopi sırasındaki yaşları, yaşadıkları yer (il/ilçe), yaşadıkları bölgede elma tarımı yapılıp yapılmadığı, sigara kullanım öyküleri, ailede kanser öyküsü, semptom durumuları, ek hastalıkları, biyopsi alınma durumu, biyopsi alınma yöntemleri, biyopsi sonucu, biyopsi sonucu kanser ya da inflamasyon/enfeksiyon ise alt tipleri kaydedilerek bronkoskopi sonuçları karşılaştırılmıştır. Çalışmada hastaların %79,2'si erkek (n=327), %20,8'i kadın (n=86) olup yaş ortalamaları 64,48±11,33 (min:19-max:91) yıl olarak bulundu. Hastaların %75,8'inin (n=313) aktif sigara kullandığı ya da geçmişte sigara kullanım öyküsü mevcuttu. Erkek (p<0,001) ve sigara kullanım öyküsü bulunan (p<0,001) hastalarda kanser görülme oranı daha yüksekti. Biyopsi türleri arasında forceps yöntemi ile alınan biyopsilerde kanser görülme oranı daha yüksekti (p<0,001). Biyopsi sonucunda hastaların çoğunlukla kanser tanısı aldığı (p<0,001) ve en sık skuamöz hücreli karsinom (p<0,001) görüldüğü tespit edildi. Isparta ilinde ikamet eden hastalarda yapılan karşılaştımada özellikle elma üretimi yapılan bölgelerde akciğer kanseri görülme oranının anlamlı şekilde yüksek olduğu bulundu (p<0,001). Sunulan çalışmadan literatürle uyumlu şekilde sigara ve erkek cinsiyetin akciğer kanseri açısından risk faktörü olduğu çıkarılabilir. Malignite düşünülen hastalarda bronkoskoi yöntemlerinden forceps kullanılması önerilebilir. Bunlara ek olarak elma üretimi yapılan bölgelerde kimyasal maruziyetinin akciğer kanserine zemin hazırladığı öngörülebilir. Elma yetiştiriciliği yaparken kullanılacak bitki koruma ürünlerinin dikkatle seçilmesiyle akciğer kanseri risk faktörlerinden en azından birinin bile olsa ortadan kaldırılabileceği göz önünde bulundurulmalıdır. Anahtar Sözcükler : Akciğer Kanseri, Bronkoskopi, Bronkopskopi Yöntemleri, Göller bölgesi, Elma Tarımı, Sigara.; Pulmonary Lung cancer, due to its high prevalence and mortality rates, represents a significant public health concern. With the advancement of diagnostic methods and increased access to healthcare, there is a growing number of diagnosed cancer cases each year. Alongside developments in early diagnosis and treatment, efforts towards preventing and protecting against lung cancer have gained importance in contemporary healthcare. This study aims to compare the demographic characteristics of patients residing in the Lakes Region, particularly in our province (85), who presented to our hospital with a preliminary diagnosis of lung cancer and underwent bronchoscopy, along with the findings obtained from the bronchoscopy procedure. A retrospective investigation was conducted on 413 patients who applied to Süleyman Demirel University Research and Application Hospital from the Lakes Region between 2018 and 2023 and underwent bronchoscopy. Demographic information, including gender, age during bronchoscopy, place of residence (province/district), apple cultivation in the region, smoking history, family history of cancer, symptom status, additional diseases, biopsy status, biopsy methods, biopsy results, and subtypes in case of cancer or inflammation/infection, were recorded and compared based on bronchoscopy results. In the study, 79.2% of the patients were male (n=327), and 20.8% were female (n=86), with an average age of 64.48±11.33 years (min:19-max:91). The majority of patients (75.8%, n=313) were either active smokers or had a history of smoking. The incidence of cancer was higher in males (p<0.001) and those with a history of smoking (p<0.001). Biopsies obtained using the forceps method had a higher rate of cancer detection (p<0.001). It was observed that the majority of patients received a cancer diagnosis following biopsy (p<0.001), with squamous cell carcinoma being the most frequently observed subtype (p<0.001). A significant increase in lung cancer incidence was found in residents of Isparta, particularly in areas engaged in apple cultivation (p<0.001). Consistent with the literature, this study suggests that smoking and male gender are risk factors for lung cancer. In cases suspected of malignancy, the use of forceps in bronchoscopy procedures may be recommended. Additionally, the study suggests a predictable association between chemical exposure in regions engaged in apple cultivation and the development of lung cancer. When practicing apple cultivation, careful selection of plant protection products should be considered to eliminate at least one of the risk factors associated with lung cancer. Keywords : Lung Cancer, Bronchoscopy, Bronchoscopy Methods, Lakes Region, Apple Cultivation, Smoking.; Tez (Tıpta Uzmanlık-PhD) - Süleyman Demirel Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı, 2024.; Kaynakça var.; Akciğer kanseri sık görülmesi ve yüksek ölüm oranlarına sahip olması nedeniyle halk sağlığı açısından önemli bir sağlık sorunudur. Tanı yöntemlerinin gelişmesi ve sağlık hizmetlerine erişimin artmasıyla her yıl daha fazla kanser vakası teşhis edilmektedir. Erken tanı ve tedavi konusundaki gelişmelerle birlikte günümüzde akciğer kanserini önleme ve korunma çalışmaları da önem kazanmaktadır. Sunulan çalışmada ilimizin (85) de içinde bulunduğu göller bölgesinde yaşayan, akciğer kanseri ön tanısı ile hastanemize başvurup bronkopskopi yapılan hastaların demografik özellikleri ile bronkoskopi işlemi sonucunda elde edilen bulguların karşılaştırılması amaçlanmıştır. Süleyman Demirel Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesine göller bölgesinden 2018-2023 yılları arasında başvuran ve bronkopskopi yapılan 413 hasta retrospektif olarak araştırılmıştır. Hastaların cinsiyetleri, bronkoskopi sırasındaki yaşları, yaşadıkları yer (il/ilçe), yaşadıkları bölgede elma tarımı yapılıp yapılmadığı, sigara kullanım öyküleri, ailede kanser öyküsü, semptom durumuları, ek hastalıkları, biyopsi alınma durumu, biyopsi alınma yöntemleri, biyopsi sonucu, biyopsi sonucu kanser ya da inflamasyon/enfeksiyon ise alt tipleri kaydedilerek bronkoskopi sonuçları karşılaştırılmıştır. Çalışmada hastaların %79,2'si erkek (n=327), %20,8'i kadın (n=86) olup yaş ortalamaları 64,48±11,33 (min:19-max:91) yıl olarak bulundu. Hastaların %75,8'inin (n=313) aktif sigara kullandığı ya da geçmişte sigara kullanım öyküsü mevcuttu. Erkek (p<0,001) ve sigara kullanım öyküsü bulunan (p<0,001) hastalarda kanser görülme oranı daha yüksekti. Biyopsi türleri arasında forceps yöntemi ile alınan biyopsilerde kanser görülme oranı daha yüksekti (p<0,001). Biyopsi sonucunda hastaların çoğunlukla kanser tanısı aldığı (p<0,001) ve en sık skuamöz hücreli karsinom (p<0,001) görüldüğü tespit edildi. Isparta ilinde ikamet eden hastalarda yapılan karşılaştımada özellikle elma üretimi yapılan bölgelerde akciğer kanseri görülme oranının anlamlı şekilde yüksek olduğu bulundu (p<0,001). Sunulan çalışmadan literatürle uyumlu şekilde sigara ve erkek cinsiyetin akciğer kanseri açısından risk faktörü olduğu çıkarılabilir. Malignite düşünülen hastalarda bronkoskoi yöntemlerinden forceps kullanılması önerilebilir. Bunlara ek olarak elma üretimi yapılan bölgelerde kimyasal maruziyetinin akciğer kanserine zemin hazırladığı öngörülebilir. Elma yetiştiriciliği yaparken kullanılacak bitki koruma ürünlerinin dikkatle seçilmesiyle akciğer kanseri risk faktörlerinden en azından birinin bile olsa ortadan kaldırılabileceği göz önünde bulundurulmalıdır. Anahtar Sözcükler : Akciğer Kanseri, Bronkoskopi, Bronkopskopi Yöntemleri, Göller bölgesi, Elma Tarımı, Sigara.; Pulmonary Lung cancer, due to its high prevalence and mortality rates, represents a significant public health concern. With the advancement of diagnostic methods and increased access to healthcare, there is a growing number of diagnosed cancer cases each year. Alongside developments in early diagnosis and treatment, efforts towards preventing and protecting against lung cancer have gained importance in contemporary healthcare. This study aims to compare the demographic characteristics of patients residing in the Lakes Region, particularly in our province (85), who presented to our hospital with a preliminary diagnosis of lung cancer and underwent bronchoscopy, along with the findings obtained from the bronchoscopy procedure. A retrospective investigation was conducted on 413 patients who applied to Süleyman Demirel University Research and Application Hospital from the Lakes Region between 2018 and 2023 and underwent bronchoscopy. Demographic information, including gender, age during bronchoscopy, place of residence (province/district), apple cultivation in the region, smoking history, family history of cancer, symptom status, additional diseases, biopsy status, biopsy methods, biopsy results, and subtypes in case of cancer or inflammation/infection, were recorded and compared based on bronchoscopy results. In the study, 79.2% of the patients were male (n=327), and 20.8% were female (n=86), with an average age of 64.48±11.33 years (min:19-max:91). The majority of patients (75.8%, n=313) were either active smokers or had a history of smoking. The incidence of cancer was higher in males (p<0.001) and those with a history of smoking (p<0.001). Biopsies obtained using the forceps method had a higher rate of cancer detection (p<0.001). It was observed that the majority of patients received a cancer diagnosis following biopsy (p<0.001), with squamous cell carcinoma being the most frequently observed subtype (p<0.001). A significant increase in lung cancer incidence was found in residents of Isparta, particularly in areas engaged in apple cultivation (p<0.001). Consistent with the literature, this study suggests that smoking and male gender are risk factors for lung cancer. In cases suspected of malignancy, the use of forceps in bronchoscopy procedures may be recommended. Additionally, the study suggests a predictable association between chemical exposure in regions engaged in apple cultivation and the development of lung cancer. When practicing apple cultivation, careful selection of plant protection products should be considered to eliminate at least one of the risk factors associated with lung cancer. Keywords : Lung Cancer, Bronchoscopy, Bronchoscopy Methods, Lakes Region, Apple Cultivation, Smoking.

http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/103081 2025-02-25T10:50:01Z

Göller bölgesinde akciğer kanseri tanısı alan hastaların demografik özellikleri, histopatolojik tipleri ve tedavilerinin prognoza etkisinin araştırılmasısı = Investigation of the effect of demographic characteristics, histopathological types and treatments on prognosis of patients diagnosed with lung cancer in the lakes region / Akciğer kanseri dünya genelinde ve Türkiye'de kansere bağlı ölümlerin önde gelen nedenidir. Tedavi modalitelerindeki gelişmelere rağmen prognozu kötü ve mortalitesi yüksek bir hastalık olmaya devam etmektedir. Temel nedeni hastaların çoğunlukla ileri evrede tanı almasıdır. Çalışmamız Göller Bölgesinde akciğer kanseri hastalarıyla yapılan ilk ulusal kayıt çalışmasıdır. Çalışmamızın amacı Süleyman Demirel Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesinde 2019-2022 yılları arasında akciğer kanseri tanısı alan hastaların demografik özellikleri, histopatolojik tipleri ve tedavilerinin prognoza etkisinin araştırılmasıdır. Hastanemizde 2019-2022 yılları arasında tanı alan 220 hasta retrospektif olarak taranmıştır. Hastaların cinsiyetleri, tanı anındaki yaşları, semptomları, sigara öyküleri, kanser alt tipleri, mutasyon analizleri, evreleri, metastaz durumları, aile öyküleri, meslekleri, yaşadıkları yerler, tedavileri, asbest ve biomass maruziyetleri, sağkalım süreleri kaydedilmiş ve demografik özelliklerin, histopatolojik tiplerin ve tedavilerin sağkalıma etkileri analiz edilmiştir. Çalışmamızda hastaların %83,2'si erkek (n=183), %16,7'si kadın (n=37) olup yaş ortalamaları 65,44±8,89 yıl olarak bulundu. Hastalardaki en sık semptom öksürüktü. Sigara öyküsü hastaların %66,8'inde mevcuttu. Her iki cinsiyette en sık görülen komorbidite hipertansiyondu. Hastaların %80,92'sini KHDAK, %15,91'ini KHAK ve %3,18'ini diğer tipler oluşturmaktaydı. Erkek cinsiyetinde en sık görülen KHDAK alt tipi SHK iken, kadın cinsiyetinde adenokanser olduğu görüldü. Hastaların %5,4'ü evre I, % 12,2'si evre II, % 34,5'i evre III, %47,2'si evre IV bulundu. En sık saptanan mutasyon EGFR testinde tespit edildi. İmmünoterapi ajanları arasında en sık kullanılan erlotinib ve nivolumab idi. Mesleği çiftçilik olan hastalarda en sık saptanan tip KHDAK olup sırasıyla SHK ve adenokanser alt tipleri görülmüştür. Erkek cinsiyetinde sağkalım süresi kadın cinsiyetine göre daha kısadır. Uzak organ metastazı olan hastaların sağkalım sürelerinin belirgin kısaldığı görülmektedir. Uygulanan tedavilerin sağkalıma etkisini değerlendirdiğimizde immünoterapinin tedaviye eklenmesinin sağkalımı belirgin artırdığı görülmüştür. Göller Bölgesindeki akciğer kanseri hastalarının genellikle ileri evrede tanı aldığı, çiftçiliğin yaygın olduğu bölgemizde meyve ağacı ilaçlamasında kullanılan pestisitlerin özellikle KHDAK (SHK ve adenokarsinom) tipinde daha sık görüldüğü sonucu çıkarıldı. Tedaviye immünoterapi ajanlarının eklenmesinin sağkalımı artırdığı kanısına varıldı. Anahtar Sözcükler : Akciğer kanseri, Demografik özellik, Göller bölgesi, Histopatolojik tip, Prognoz.; Lung cancer is a leading cause of cancer-related deaths worldwide and in Turkey. Despite advances in treatment modalities, it continues to be a disease with poor prognosis and high mortality rates. The main reason for this is that most patients are diagnosed at an advanced stage. Our study is the first national registry study conducted with lung cancer patients in the Lakes Region. The aim of our study is to investigate the demographic characteristics, histopathological types, and the effect of treatment on prognosis of patients diagnosed with lung cancer at Süleyman Demirel University Research and Application Hospital between 2019-2022. A total of 220 patients diagnosed between 2019-2022 at our hospital were retrospectively reviewed. The patients' genders, ages at diagnosis, symptoms, smoking histories, cancer subtypes, mutation analyses, stages, metastatic status, family histories, occupations, places of residence, treatments, asbestos and biomass exposures, and survival times were recorded, and the effects of demographic characteristics, histopathological types, and treatments on survival were analyzed. In our study, 83.2% of the patients were male (n=183) and 16.7% were female (n=37), with a mean age of 65.44±8.89 years. Cough was the most common symptom among patients. Smoking history was present in 66.8% of the patients. The most common comorbidity in both genders was hypertension. Among the patients, 80.92% had NSCLC, 15.91% had SCLC, and 3.18% had other types. The most common subtype of NSCLC in males was squamous cell carcinoma, while in females, it was adenocarcinoma. 5.4% of the patients were stage I, 12.2% were stage II, 34.5% were stage III, and 47.2% were stage IV. The most commonly detected mutation was found in EGFR testing. Erlotinib and nivolumab were the most commonly used immunotherapy agents. Among patients with farming occupation, the most common type observed was NSCLC, followed by SCLC and adenocarcinoma subtypes. Survival time in males was shorter compared to females. Patients with distant organ metastasis had significantly shorter survival times. Evaluation of the effect of treatments on survival revealed that adding immunotherapy to the treatment significantly increased survival. It was concluded that lung cancer patients in the Lakes Region are often diagnosed at an advanced stage, and pesticides used in fruit tree spraying, especially in NSCLC (squamous cell carcinoma and adenocarcinoma) types, are more common in our region where farming is widespread. It was also concluded that adding immunotherapy agents to treatment increases survival. Keywords : Lung cancer, Demographic characteristics, Lakes region, Histopathological type, Prognosis.; Tez (Tıpta Uzmanlık-PhD) - Süleyman Demirel Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı, 2024.; Kaynakça var.; Akciğer kanseri dünya genelinde ve Türkiye'de kansere bağlı ölümlerin önde gelen nedenidir. Tedavi modalitelerindeki gelişmelere rağmen prognozu kötü ve mortalitesi yüksek bir hastalık olmaya devam etmektedir. Temel nedeni hastaların çoğunlukla ileri evrede tanı almasıdır. Çalışmamız Göller Bölgesinde akciğer kanseri hastalarıyla yapılan ilk ulusal kayıt çalışmasıdır. Çalışmamızın amacı Süleyman Demirel Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesinde 2019-2022 yılları arasında akciğer kanseri tanısı alan hastaların demografik özellikleri, histopatolojik tipleri ve tedavilerinin prognoza etkisinin araştırılmasıdır. Hastanemizde 2019-2022 yılları arasında tanı alan 220 hasta retrospektif olarak taranmıştır. Hastaların cinsiyetleri, tanı anındaki yaşları, semptomları, sigara öyküleri, kanser alt tipleri, mutasyon analizleri, evreleri, metastaz durumları, aile öyküleri, meslekleri, yaşadıkları yerler, tedavileri, asbest ve biomass maruziyetleri, sağkalım süreleri kaydedilmiş ve demografik özelliklerin, histopatolojik tiplerin ve tedavilerin sağkalıma etkileri analiz edilmiştir. Çalışmamızda hastaların %83,2'si erkek (n=183), %16,7'si kadın (n=37) olup yaş ortalamaları 65,44±8,89 yıl olarak bulundu. Hastalardaki en sık semptom öksürüktü. Sigara öyküsü hastaların %66,8'inde mevcuttu. Her iki cinsiyette en sık görülen komorbidite hipertansiyondu. Hastaların %80,92'sini KHDAK, %15,91'ini KHAK ve %3,18'ini diğer tipler oluşturmaktaydı. Erkek cinsiyetinde en sık görülen KHDAK alt tipi SHK iken, kadın cinsiyetinde adenokanser olduğu görüldü. Hastaların %5,4'ü evre I, % 12,2'si evre II, % 34,5'i evre III, %47,2'si evre IV bulundu. En sık saptanan mutasyon EGFR testinde tespit edildi. İmmünoterapi ajanları arasında en sık kullanılan erlotinib ve nivolumab idi. Mesleği çiftçilik olan hastalarda en sık saptanan tip KHDAK olup sırasıyla SHK ve adenokanser alt tipleri görülmüştür. Erkek cinsiyetinde sağkalım süresi kadın cinsiyetine göre daha kısadır. Uzak organ metastazı olan hastaların sağkalım sürelerinin belirgin kısaldığı görülmektedir. Uygulanan tedavilerin sağkalıma etkisini değerlendirdiğimizde immünoterapinin tedaviye eklenmesinin sağkalımı belirgin artırdığı görülmüştür. Göller Bölgesindeki akciğer kanseri hastalarının genellikle ileri evrede tanı aldığı, çiftçiliğin yaygın olduğu bölgemizde meyve ağacı ilaçlamasında kullanılan pestisitlerin özellikle KHDAK (SHK ve adenokarsinom) tipinde daha sık görüldüğü sonucu çıkarıldı. Tedaviye immünoterapi ajanlarının eklenmesinin sağkalımı artırdığı kanısına varıldı. Anahtar Sözcükler : Akciğer kanseri, Demografik özellik, Göller bölgesi, Histopatolojik tip, Prognoz.; Lung cancer is a leading cause of cancer-related deaths worldwide and in Turkey. Despite advances in treatment modalities, it continues to be a disease with poor prognosis and high mortality rates. The main reason for this is that most patients are diagnosed at an advanced stage. Our study is the first national registry study conducted with lung cancer patients in the Lakes Region. The aim of our study is to investigate the demographic characteristics, histopathological types, and the effect of treatment on prognosis of patients diagnosed with lung cancer at Süleyman Demirel University Research and Application Hospital between 2019-2022. A total of 220 patients diagnosed between 2019-2022 at our hospital were retrospectively reviewed. The patients' genders, ages at diagnosis, symptoms, smoking histories, cancer subtypes, mutation analyses, stages, metastatic status, family histories, occupations, places of residence, treatments, asbestos and biomass exposures, and survival times were recorded, and the effects of demographic characteristics, histopathological types, and treatments on survival were analyzed. In our study, 83.2% of the patients were male (n=183) and 16.7% were female (n=37), with a mean age of 65.44±8.89 years. Cough was the most common symptom among patients. Smoking history was present in 66.8% of the patients. The most common comorbidity in both genders was hypertension. Among the patients, 80.92% had NSCLC, 15.91% had SCLC, and 3.18% had other types. The most common subtype of NSCLC in males was squamous cell carcinoma, while in females, it was adenocarcinoma. 5.4% of the patients were stage I, 12.2% were stage II, 34.5% were stage III, and 47.2% were stage IV. The most commonly detected mutation was found in EGFR testing. Erlotinib and nivolumab were the most commonly used immunotherapy agents. Among patients with farming occupation, the most common type observed was NSCLC, followed by SCLC and adenocarcinoma subtypes. Survival time in males was shorter compared to females. Patients with distant organ metastasis had significantly shorter survival times. Evaluation of the effect of treatments on survival revealed that adding immunotherapy to the treatment significantly increased survival. It was concluded that lung cancer patients in the Lakes Region are often diagnosed at an advanced stage, and pesticides used in fruit tree spraying, especially in NSCLC (squamous cell carcinoma and adenocarcinoma) types, are more common in our region where farming is widespread. It was also concluded that adding immunotherapy agents to treatment increases survival. Keywords : Lung cancer, Demographic characteristics, Lakes region, Histopathological type, Prognosis.