| dc.creator |
KARAKURT, Tuncay; AHİ EVRAN ÜNİVERSİTESİ |
|
| dc.creator |
MERAL, Seher; ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ |
|
| dc.creator |
ALAMAN AĞAR, Ayşen; ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ |
|
| dc.date |
2019-08-25T00:00:00Z |
|
| dc.date.accessioned |
2020-01-02T08:34:20Z |
|
| dc.date.available |
2020-01-02T08:34:20Z |
|
| dc.identifier |
https://dergipark.org.tr/tr/pub/sdufenbed/issue/46929/530279 |
|
| dc.identifier |
10.19113/sdufenbed.530279 |
|
| dc.identifier.uri |
http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/49368 |
|
| dc.description |
Schiff bazı ve tiyazolhalkası içeren 2,2'-((1E,1'E)-(ethan-1,2-dibis(azaneliden))bis(methaneliden))bis(4-(trifloromethoksi)fenoltek kristali bu çalışmada sentezlenmiştir. Sentezlenen kristalin yapısı, IRspektroskopik ve X-ışınları analizi teknikleri kullanılarak aydınlatılmıştır. İncelenenbileşiğin fenol–imin ve keto–amin gibi iki farklı tautomer formda olabileceğigörülmüştür. Deneysel ve teorik tüm çalışmalar iki tautomer yapı üzerinde yapılmıştır.Bunun içinde bileşiğin yapısal parametreleri, GAUSSIAN 09W paket programı veDFT/B3LYP teorisi ile optimize edildikten sonra IRC (intrinsic reactioncoordinate), frontier moleküler orbital(FMO) hesaplamaları yapılmıştır. IRCçalışmasında fenol-imin formunun keto-amin formuna göre daha düşük enerjiyesahip olduğu gözlenmiş olup iki form arasındaki enerji farkı -14.71 kj/mololarak hesaplanmıştır. Ayrıca, fenol-imin ve keto-amin formlarına ait HOMOenerji değerleri sırasıyla, -6.31 ve -5.77 eV olarak hesaplanmıştır. Son olarakda iki tautomer yapının antifungal aktivite çalışmaları için 2RKV protein yapısına inhibitör ajan olabilmesiyönünde Moleküler Doking çalışması yapılmıştır. Bu hesaplama sonucundafenol-imin ve keto-amin formuna ait affinite değerleri (Doking skoru) sırasıyla,-7.7 ve -7.3 kcal/mol olarak elde edilmiş olup HOMO orbital enerjileriile affinite değerlerinin orantılı olduğu çalışmamızda gözlenmiştir. |
|
| dc.description |
2,2'-((1E,1'E)-(ethane-1,2-diylbis(azaneylylidene))bis(methaneylylidene))bis(4-(trifluoromethoxy)phenolsingle crystal containing Schiff base and thiazole ring was synthesized in thiswork. The synthesized crystalline structure was confirmed using IRspectroscopic and X-ray analysis techniques. It has been found that theanalyzed compound may be two different tautomer forms such as phenol-imine andketo-amine. All experimental and theoretical studies were made on the twotautomeric structures. For this purpose, IRC (intrinsic reaction coordinate)and frontier molecular orbital (FMO) calculations were performed after thestructural parameters of the title compound were optimized using GAUSSIAN 09Wpackage program andDFT/B3LYP theory. In theIRC study, it was observed that the phenol-imine form had lower energy than theketo-amine form and the energy difference between the two forms was calculatedas -14.71 kj/mol. HOMO energy values of phenol-imine and keto-amine forms wascalculated as -6.31 and -5.77 eV, respectively. Finally,Molecular Docking study was performed for the 2RKV protein structure to be aninhibitory agent for the antifungal activity studies of the two tautomer forms. As aresult of this calculation, the affinity values of the phenol-imine andketo-amine form (Docking score) were obtained as -7.7 and -7.3 kcal / mol,respectively, and it was observed in our study that the HOMO orbital energiesand the affinity values were proportional. |
|
| dc.format |
application/pdf |
|
| dc.language |
tr |
|
| dc.publisher |
Süleyman Demirel University |
|
| dc.publisher |
Süleyman Demirel Üniversitesi |
|
| dc.relation |
https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/784829 |
|
| dc.source |
Volume: 23, Issue: 2
505-514 |
en-US |
| dc.source |
1308-6529 |
|
| dc.subject |
Gaussian 09W,Fenol–imin,Keto–amin,Moleküler doking |
|
| dc.subject |
Gaussian 09W,Phenol–imine,Keto–amine,Molecular docking |
|
| dc.title |
Schiff Bazı İçeren Tek Kristal Bileşik Üzerinde X-Işınları, Spektroskopik ve Moleküler Doking Çalışmaları |
tr-TR |
| dc.title |
X-Rays, Spectroscopic and Molecular Docking Studies on Single Crystal Compounds Containing Schiff Base |
en-US |
| dc.type |
info:eu-repo/semantics/article |
|