| dc.creator |
Çapar, Erdem,
1982-
author
28461 |
|
| dc.creator |
Koşar, Alim,
1965-
thesis advisor
18373 |
|
| dc.creator |
Süleyman Demirel Üniversitesi.
Tıp Fakültesi.
Genel Cerrahi Anabilim Dalı.
issuing body
10634 |
|
| dc.date |
2012. |
|
| dc.date.accessioned |
2025-02-25T10:49:12Z |
|
| dc.date.available |
2025-02-25T10:49:12Z |
|
| dc.identifier |
http://tez.sdu.edu.tr/Tezler/TT00728.pdf |
|
| dc.identifier.uri |
http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/102745 |
|
| dc.description |
Giriş: Yüzeyel mesane tümörlü hastaların %70’den fazlasında başlangıç TURM (mesane transüretral rezeksiyonu) sonrası bir veya daha fazla rekürrens gözlenir, ve yaklaşık bu hastaların üçte birinde hastalık progresyon gösterir. Rekürrens ve progresyon hızı nedeniyle mesane kanserinde hayat boyu sistoskopik kontrole ihtiyaç duyulur.Bu nedenle tedavi hedeflerini belirlemek ve üretelyal tümörlerin tanısında sistoskopinin etkinliğini arttırmak için onkogenik mutasyonların tesbit edilmesine ihtiyaç duyulmaktadır.İnsan kanserlerinde RAS/RAF/MAPKinaz yolağı protoonkogenlerinin mutasyonları en sık görülen genetik değişikliklerdendir. somatik mutasyonlar primer ve rekürren üreteliyal tümörlerde erken tanıda ve tedavi takibinde kullanılabilir.Materyal ve metod: Çalışmamıza histolojik tanıları konulmuş 46 mesane kanserli olgunun tümörlü dokuları, sağlıklı dokuları ve kanlarından elde edilen DNA’larda ilgili mutasyonların karşılaştırılması planlanmıştır. Dokularında BRAF ve KRAS proto-onkojeni polimorfizmlerini saptamak için polimeraz zincir reaksiyonu tekniğine dayalı MassARRAY® teknolojisi (İPLEX®) ile tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP) genotipleme tekniği kullanılmıştır.Bulgular: Olguların tümör dokularında 45(%97.8)’inde T1796A transversiyonuna bağlı BRAF V600E mutasyonunun varlığı tespit edilmiştir. Bir olguda KRAS geninin 12.Kodonunda GGT>AGT transisyonu sonucu meydana gelen Gly12Serin aminoasidine değişimine yol açan bir mutasyonu saptanmıştır. Bu olguda BRAF mutasyonu saptanmamıştır. Çalışmamızda herhangi bir istatistik çalışmaya olanak vermeyen veriler elde edilmiştir. Küçük örnek olduğu için normal istatistiksel yaklaşımlar uygun olmamaktadır. Yapılan fisher-exact testi sonucunda da p-value her seferinde ‘1’ olarak bulunmuştur.Sonuç olarak, RAS/RAF/MAP kinaz yolağında meydana gelen çeşitli mutasyonların pek çok kanserle ilişkili olduğu literatürde belirtilmektedir. Araştırmamızda 45 (%97.8)’inde T1796A transversiyonuna bağlı B-Raf V600E mutasyonunun varlığı tespit edilmiştir. Ayrıca çalışmamızda tek bir olguda K-Ras mutasyonunun saptanması Türk toplumunda mesane kanserine yatkınlıkta önemli bir rolü olmadığını göstermiştir. Bir Ras efektör proteini olan B-Raf’ta meydana gelen mutasyonlar proteinlerin aktivitelerini etkileyerek yolağın normal dışı çalışmasına ve kanser hücrelerinin kontrolsüz hücre büyümesi, kontrolsüz farklılaşma ve apoptoza direnç gibi özellikler kazanmalarına yol açmaktadır. Anahtar Kelimeler : onkojenler, mesane kanser. |
|
| dc.description |
Objectives: After initial TURB, 70% of patients with non-muscle-invasive bladder cancer have develop one or more recurrences and one third of them will progress to invasive tumor. The recurrence risk and risk of progression necessitate a life-long followup by cystoscopy. Otherwise, it is necessary to discover oncogenic mutations to increase effectiviness of cystoscopy for diagnosis of urothelial tumors, and to determine theraphy targets.RAS/RAF/MAP Kinase pathway protooncogene mutations in the human cancers are the most common observed genetic alterations. In urothelial tumors somatic mutations in the RAS/RAF/MAP Kinase pathway genes may be of use for early detection of primary and recurrent tumors, for follow up targeted therapies in tissue-based assays.Materials and methods: We plannned to compare the mutations in the DNA obtained from tumor tissues, healthy tissues and blood of 46 patients who were diagnosed bladder cancer histologically. To determine BRAF and KRAS proto-oncogene polymorphisms we used MassARRAY® (İPLEX®) single nucleotid polymorphism genotyping technic based on the technique of polymerase chain reaction.Results: We determined BRAF V600E mutation based on T1796A transversion in the tumor tissues of 45 (%97.8) patients. And we determined Gly12Serin mutation at the twelfth codon of KRAS gene based on GGT>AGT transition in only one patient. This patient hasn’t got BRAF V600E mutation. There were no mutation in the healthy tissues and blood of 46 patients. The normal approximation may be inaccurate for small samples instatistical analyses. Fisher's exact test: P-Value = 1,000.Conclusions: A variety of mutations that occur in RAS/RAF/MAP kinase pathway is reported in the literature to be associated with a wide variety of cancer types. In our study the incidence of BRAF V600E mutations in bladder cancer patients is %97.8. Kras mutation doesn’t play a role in bladder cancer susceptibility in the Turkish population.Mutations that occur in BRAF, is a RAS Effector protein , shows the uncontrolled growth , differentiation and resistance to apoptosis of the cells by affecting the activity of proteins and by causing abnormal operation of the pathway.We studied related mutations in the same patient's tumor tissues, healthy tissues and blood tissues. While in the tumor tissues various mutations have been identified in different stages of the signaling pathway , there were no mutation in the healthy tissues and blood of 46 patients.Though we think the deterioration of signaling pathways is of tumor-related, we found signaling pathways is not cause of tumor development.Therefore to evaluate progression, invasion, metastasis and prognosis of the tumor, we need to add more cases to the study.A variety of mutations that occur in cell signal pathway is reported in the literature to be associated with canceration of bladder. But we claim that deterioration of signaling pathways is of tumor-related and carcinogenesis is related to different pathways. Keywords : onkogenes, bladder cancer. |
|
| dc.description |
Tez, (Uzmanlık Tezi) Süleyman Demirel Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Üroloji Anabilim Dalı, 2012. |
|
| dc.description |
Kaynakça var. |
|
| dc.description |
Giriş: Yüzeyel mesane tümörlü hastaların %70’den fazlasında başlangıç TURM (mesane transüretral rezeksiyonu) sonrası bir veya daha fazla rekürrens gözlenir, ve yaklaşık bu hastaların üçte birinde hastalık progresyon gösterir. Rekürrens ve progresyon hızı nedeniyle mesane kanserinde hayat boyu sistoskopik kontrole ihtiyaç duyulur.Bu nedenle tedavi hedeflerini belirlemek ve üretelyal tümörlerin tanısında sistoskopinin etkinliğini arttırmak için onkogenik mutasyonların tesbit edilmesine ihtiyaç duyulmaktadır.İnsan kanserlerinde RAS/RAF/MAPKinaz yolağı protoonkogenlerinin mutasyonları en sık görülen genetik değişikliklerdendir. somatik mutasyonlar primer ve rekürren üreteliyal tümörlerde erken tanıda ve tedavi takibinde kullanılabilir.Materyal ve metod: Çalışmamıza histolojik tanıları konulmuş 46 mesane kanserli olgunun tümörlü dokuları, sağlıklı dokuları ve kanlarından elde edilen DNA’larda ilgili mutasyonların karşılaştırılması planlanmıştır. Dokularında BRAF ve KRAS proto-onkojeni polimorfizmlerini saptamak için polimeraz zincir reaksiyonu tekniğine dayalı MassARRAY® teknolojisi (İPLEX®) ile tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP) genotipleme tekniği kullanılmıştır.Bulgular: Olguların tümör dokularında 45(%97.8)’inde T1796A transversiyonuna bağlı BRAF V600E mutasyonunun varlığı tespit edilmiştir. Bir olguda KRAS geninin 12.Kodonunda GGT>AGT transisyonu sonucu meydana gelen Gly12Serin aminoasidine değişimine yol açan bir mutasyonu saptanmıştır. Bu olguda BRAF mutasyonu saptanmamıştır. Çalışmamızda herhangi bir istatistik çalışmaya olanak vermeyen veriler elde edilmiştir. Küçük örnek olduğu için normal istatistiksel yaklaşımlar uygun olmamaktadır. Yapılan fisher-exact testi sonucunda da p-value her seferinde ‘1’ olarak bulunmuştur.Sonuç olarak, RAS/RAF/MAP kinaz yolağında meydana gelen çeşitli mutasyonların pek çok kanserle ilişkili olduğu literatürde belirtilmektedir. Araştırmamızda 45 (%97.8)’inde T1796A transversiyonuna bağlı B-Raf V600E mutasyonunun varlığı tespit edilmiştir. Ayrıca çalışmamızda tek bir olguda K-Ras mutasyonunun saptanması Türk toplumunda mesane kanserine yatkınlıkta önemli bir rolü olmadığını göstermiştir. Bir Ras efektör proteini olan B-Raf’ta meydana gelen mutasyonlar proteinlerin aktivitelerini etkileyerek yolağın normal dışı çalışmasına ve kanser hücrelerinin kontrolsüz hücre büyümesi, kontrolsüz farklılaşma ve apoptoza direnç gibi özellikler kazanmalarına yol açmaktadır. Anahtar Kelimeler : onkojenler, mesane kanser. |
|
| dc.description |
Objectives: After initial TURB, 70% of patients with non-muscle-invasive bladder cancer have develop one or more recurrences and one third of them will progress to invasive tumor. The recurrence risk and risk of progression necessitate a life-long followup by cystoscopy. Otherwise, it is necessary to discover oncogenic mutations to increase effectiviness of cystoscopy for diagnosis of urothelial tumors, and to determine theraphy targets.RAS/RAF/MAP Kinase pathway protooncogene mutations in the human cancers are the most common observed genetic alterations. In urothelial tumors somatic mutations in the RAS/RAF/MAP Kinase pathway genes may be of use for early detection of primary and recurrent tumors, for follow up targeted therapies in tissue-based assays.Materials and methods: We plannned to compare the mutations in the DNA obtained from tumor tissues, healthy tissues and blood of 46 patients who were diagnosed bladder cancer histologically. To determine BRAF and KRAS proto-oncogene polymorphisms we used MassARRAY® (İPLEX®) single nucleotid polymorphism genotyping technic based on the technique of polymerase chain reaction.Results: We determined BRAF V600E mutation based on T1796A transversion in the tumor tissues of 45 (%97.8) patients. And we determined Gly12Serin mutation at the twelfth codon of KRAS gene based on GGT>AGT transition in only one patient. This patient hasn’t got BRAF V600E mutation. There were no mutation in the healthy tissues and blood of 46 patients. The normal approximation may be inaccurate for small samples instatistical analyses. Fisher's exact test: P-Value = 1,000.Conclusions: A variety of mutations that occur in RAS/RAF/MAP kinase pathway is reported in the literature to be associated with a wide variety of cancer types. In our study the incidence of BRAF V600E mutations in bladder cancer patients is %97.8. Kras mutation doesn’t play a role in bladder cancer susceptibility in the Turkish population.Mutations that occur in BRAF, is a RAS Effector protein , shows the uncontrolled growth , differentiation and resistance to apoptosis of the cells by affecting the activity of proteins and by causing abnormal operation of the pathway.We studied related mutations in the same patient's tumor tissues, healthy tissues and blood tissues. While in the tumor tissues various mutations have been identified in different stages of the signaling pathway , there were no mutation in the healthy tissues and blood of 46 patients.Though we think the deterioration of signaling pathways is of tumor-related, we found signaling pathways is not cause of tumor development.Therefore to evaluate progression, invasion, metastasis and prognosis of the tumor, we need to add more cases to the study.A variety of mutations that occur in cell signal pathway is reported in the literature to be associated with canceration of bladder. But we claim that deterioration of signaling pathways is of tumor-related and carcinogenesis is related to different pathways. Keywords : onkogenes, bladder cancer. |
|
| dc.language |
tur |
|
| dc.publisher |
Isparta : SDÜ Tıp Fakültesi, |
|
| dc.subject |
Süleyman Demirel Üniversitesi |
|
| dc.title |
Mesane kanserinde K-Ras protoonkogen mutasyonlarının araştırılması = Investigation of K-Ras protooncogene mutations in bladder cancer / |
|
| dc.type |
text |
|