| dc.creator |
KARABACAK ATAY, Çiğdem; BURDUR MEHMET AKİF ERSOY ÜNİVERSİTESİ |
|
| dc.creator |
TİLKİ, Tahir; SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ |
|
| dc.creator |
DEDE, Bülent; SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ |
|
| dc.date |
2019-05-31T00:00:00Z |
|
| dc.date.accessioned |
2019-07-09T11:48:36Z |
|
| dc.date.available |
2019-07-09T11:48:36Z |
|
| dc.identifier |
http://dergipark.org.tr/sdufeffd/issue/45380/544174 |
|
| dc.identifier |
10.29233/sdufeffd.544174 |
|
| dc.identifier.uri |
http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/45747 |
|
| dc.description |
Buçalışmada, önceki çalışmalarımızda sentezlediğimiz üç azo boyarmaddenin, 2 -[(3,5-diamino-1H-pirazol-4-il)diazenil]-5-nitrobenzoik asit (A),2-[(3,5)-dimetil-1H-pirazol-4-il) diazenil]-5-nitrobenzoik asit (B) ve2-[(5-amino-3-metil-1H-pirazol-4-il) diazenil]-5-nitrobenzoik asit (C),potansiyel antibakteriyel özelliklerini araştırmak için moleküler dokingçalışmaları yapıldı. Modelleme,SwissDock web sunucusunda EADock DSS algoritması kullanılarak gerçekleştirildi. Olasıbağlanma konformasyonları ve inhibe edici etkileri belirlemek için E. coli beta-ketoaçil-açil taşıyıcıprotein sentaz III (KAS III) aktif bölgesine ligandların (A, B ve C) bağlanmasimülasyonları yapıldı.Doking sonuçları ayrıca ticari bir antibakteriyel madde olarakkullanılan triklosan ile karşılaştırıldı ve B bileşiğinin en iyi antibakteriyelözelliğe sahip olduğu bulundu. |
|
| dc.description |
Inthis study, molecular docking studies were applied to three azo dyes,2-[(3,5-diamino-1H-pyrazol-4-yl)diazenyl]-5-nitrobenzoic acid (A),2-[(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)diazenyl]-5-nitrobenzoic acid (B) and2-[(5-amino-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)diazenyl]-5-nitrobenzoic acid (C), whichsynthesized in our previous studies, to investigate their potentialantibacterial properties. Modelling was performed on SwissDock web server usingEADock DSS algorithm. Docking simulations of ligands (A, B and C) wereperformed into the E. coli beta-ketoacyl-acylcarrier protein synthase III (KAS III) active site to determine the probablebinding conformations and inhibitory effects. Docking results were alsocompared with triclosan used as a commercial antibacterial agent and it wasfound that compound B had the best antibacterial property. |
|
| dc.format |
application/pdf |
|
| dc.language |
en |
|
| dc.publisher |
Süleyman Demirel University |
|
| dc.publisher |
Süleyman Demirel Üniversitesi |
|
| dc.relation |
http://dergipark.org.tr/download/article-file/721343 |
|
| dc.source |
Volume: 14, Issue: 1
150-154 |
en-US |
| dc.source |
1306-7575 |
|
| dc.subject |
Moleküler kenetlenme,Azo bileşik,Antibakteriyel özellikler,Protein |
|
| dc.subject |
Molecular docking,Azo compound,Antibacterial properties,Protein |
|
| dc.title |
Moleküler Docking Yöntemi ile Bazı Azo Bileşiklerinin Potansiyel Antibakteriyel Özelliklerinin İncelenmesi |
en-US |
| dc.title |
Investigation of Potential Antibacterial Properties of Some Azo Compounds by Molecular Docking Method |
en-US |
| dc.type |
info:eu-repo/semantics/article |
|