| dc.creator |
ERSOY, AHMET TAHİR |
|
| dc.creator |
Onuk, Ertan Emek |
|
| dc.creator |
METİN, SEÇİL |
|
| dc.date |
2018-11-30T21:00:00Z |
|
| dc.date.accessioned |
2020-10-06T11:26:22Z |
|
| dc.date.available |
2020-10-06T11:26:22Z |
|
| dc.identifier |
dfc8766d-ad7d-4351-98b6-a1baedb7fbdf |
|
| dc.identifier |
https://avesis.sdu.edu.tr/publication/details/dfc8766d-ad7d-4351-98b6-a1baedb7fbdf/oai |
|
| dc.identifier.uri |
http://acikerisim.sdu.edu.tr/xmlui/handle/123456789/74143 |
|
| dc.description |
<p>Bu çalışma ile Akdeniz bölgesinde bulunan 14 farklı gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss<br />Walbaum, 1792) işletmesinde Flavobacterium psychrophilum’un varlığı ile fenotipik ve genotipik<br />özelliklerinin araştırılması hedeflenmiştir. Bu amaçla Kasım 2012-Mart 2013 tarihleri arasında ticari alabalık<br />işletmelerinden sperm, yumurta, gözlenmiş yumurta, keseli larva ve 0.2-5 gr ağırlığındaki larvalardan örnekler<br />alınmıştır. Örneklerden olası F. pyschrophilum’un izolasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik metotlar<br />kullanılarak yapılmış ve toplamda 172 adet izolat elde edilmiştir. Elde edilen tüm izolatların enzim aktivitesi<br />API ZYM test sistemine göre tespit edilmiştir. Yapılan fenotipik testler sonucunda F. psychrophilum olduğu<br />düşünülen 65 izolat belirlenmiştir. Bu izolatların moleküler olarak doğrulanmasında F. pyschrophilum spesifik<br />Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) metodu kullanılmıştır. Hasta balıklardan izole edilen 17 izolatın (11<br />karaciğer, 3 dalak ve 3 böbrek) F. psychrophilum’a özgü 971 bp’lik bant verdiği saptanmıştır. İzolatlar arası<br />klonal ilişkinin belirlenmesi amacıyla RAPD-PCR metodu kullanılmıştır. Bu metoda göre F. psychrophilum<br />izolatlarının beş farklı RAPD bant paterni (F1-F5) verdiği saptanmıştır. İzolatların % 85 benzerlik katsayısına<br />göre bir “unique” tip (F1 nolu genotip) ve bir küme içerisinde gruplandığı belirlenmiştir. Yapılan<br />antibiyogram testi sonucu, izolatların trimetroprim/sulfametakzol, klindamisine, ampisillin, tekrasiklin,<br />enrofloksasin, kloramfenikole, oksitetrasiklin, florfenikol ve tobramisin’e duyarlı olduğu belirlenmiştir. Sonuç<br />olarak, bu çalışmadan elde edilen bulgular RAPD-PCR'da kullanılan M13 primerinin F. psychrophilum<br />izolatları arasındaki klonal ilişkinin belirlenmesinde kullanılabilir olduğunu göstermiştir.</p><p> </p> |
|
| dc.description |
<p>In this study, it was aimed to investigate the phenotypic and genotypic characteristics with presence of<br />Flavobacterium psychrophilum in fourteen rainbow trout farms in Mediterranean Region. For this purpose,<br />sperm, eyed egg, egg, yolk-sac larvae and 0,2-5 g fry were sampled from commercial trout farms between<br />November 2012- March 2013. Isolation of potential F.psychrophilum from samples was made using<br />conventional microbiological methods and a total of 172 obtained strains. Enzyme activity of all isolates was<br />identified according to the API ZYM test system. As a result of the phenotypic tests, 65 isolates thought to be<br />F. psychrophilum were identified. PCR assay was used in molecular confirming of these strains. It was<br />determined that, 17 strains isolated from diseased fish (11 of them liver, 3 of them spleen, 3 of them kidney)<br />gave specific 971 bp band which was specific to F.psychrophilum. RAPD-PCR assay was used to identify the<br />clonal relationship between strains. F. psychrophilum isolates were yielded five different RAPD band patterns<br />(F1-F5) according to this method. This strains detected to be grouped into 1 cluster and according to similarity<br />coefficient %85 "unique" type (F1 the genotype). According to antibiotic sensitivity tests, isolates were found<br />to be sensitive to trimetroprim/sulfamethoxazole, clindamycin, ampicillin, tetracycline, enrofloxacin,<br />chloramphenicol, oxytetracycline, florfenicol and tobramycine. In conclusion, the findings from this study showed that the M13 primer used in RAPD-PCR can be used to determine the clonal relationship between F.<br />psychrophilum isolates. </p><p> </p> |
|
| dc.language |
tur |
|
| dc.rights |
info:eu-repo/semantics/closedAccess |
|
| dc.title |
Akdeniz Bölgesindeki Gökkuşağı Alabalıklarından İzole Edilen Flavobacteriumpsychrophilum Suşlarının Fenotipik Ve Genetik Farklılıklarının Belirlenmesi |
|
| dc.type |
info:eu-repo/semantics/article |
|