Buçalışmada, önceki çalışmalarımızda sentezlediğimiz üç azo boyarmaddenin, 2 -[(3,5-diamino-1H-pirazol-4-il)diazenil]-5-nitrobenzoik asit (A),2-[(3,5)-dimetil-1H-pirazol-4-il) diazenil]-5-nitrobenzoik asit (B) ve2-[(5-amino-3-metil-1H-pirazol-4-il) diazenil]-5-nitrobenzoik asit (C),potansiyel antibakteriyel özelliklerini araştırmak için moleküler dokingçalışmaları yapıldı. Modelleme,SwissDock web sunucusunda EADock DSS algoritması kullanılarak gerçekleştirildi. Olasıbağlanma konformasyonları ve inhibe edici etkileri belirlemek için E. coli beta-ketoaçil-açil taşıyıcıprotein sentaz III (KAS III) aktif bölgesine ligandların (A, B ve C) bağlanmasimülasyonları yapıldı.Doking sonuçları ayrıca ticari bir antibakteriyel madde olarakkullanılan triklosan ile karşılaştırıldı ve B bileşiğinin en iyi antibakteriyelözelliğe sahip olduğu bulundu.
Inthis study, molecular docking studies were applied to three azo dyes,2-[(3,5-diamino-1H-pyrazol-4-yl)diazenyl]-5-nitrobenzoic acid (A),2-[(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)diazenyl]-5-nitrobenzoic acid (B) and2-[(5-amino-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)diazenyl]-5-nitrobenzoic acid (C), whichsynthesized in our previous studies, to investigate their potentialantibacterial properties. Modelling was performed on SwissDock web server usingEADock DSS algorithm. Docking simulations of ligands (A, B and C) wereperformed into the E. coli beta-ketoacyl-acylcarrier protein synthase III (KAS III) active site to determine the probablebinding conformations and inhibitory effects. Docking results were alsocompared with triclosan used as a commercial antibacterial agent and it wasfound that compound B had the best antibacterial property.